Övriga mål för bortalaget gjordes av Albin Flodkvist och Eldin Lugonja, målen för Trosa Vagnhärad gjordes av Fauzi Adam och David Strömgren.
Första halvlek var mållös, i andra halvlek var IFK Eskilstuna det starkaste laget.
Trosa Vagnhärad har en vinst, en oavgjord och tre förluster på de senaste fem matcherna, medan IFK Eskilstuna har tre vinster, en oavgjord och en förlust.
Resultaten i sista omgången betyder att Trosa Vagnhärad slutar på 13:e plats i tabellen, och IFK Eskilstuna på tionde plats.