Vittnen säger att de som attackerade gruppen om 20-30 personer ropade namnet på den lokala fotbollsklubben Lechia. Polisen ska titta på videor från övervakningskameror för att kunna göra gripanden.
Borgmästaren Aleksandra Dulkiewicz fördömer attacken och säger i ett uttalande att Gdansk är en öppen stad där det inte finns plats för våld.
Upp till 9 500 personer tillåts på läktarna på arenan i Gdansk, med minst 2 000 supportrar influgna från Spanien och Storbritannien.