Segermålet för Södertälje FF stod Levi Can för efter 46 minuter.
Första halvlek blev mållös, men direkt efter pausen slog Levi Can till och gav Södertälje FF ledningen.
I den 90:e minuten fick Södertälje FF Christ Mourad utvisad, och fick spela med en man mindre sista sista minuterna.
I tabellen innebär det här att Södertälje FF nu ligger på tredje plats. Malmköping är på sjätte plats.
I nästa omgång har Malmköping Triangeln hemma på Sparbanksvallen, fredag 2 juli 19.00.