Efter att en stor mängd fisk dött inhämtades prover för analys. Proverna har analyserats av Statens veterinärmedicinska anstalt, SVA. SVA har inte hittat något som direkt kan förklara vad fiskarna dog av. Vattenproverna som analyserades visar på en dominans av kiselalger. Det provet togs av yrkesfiskare den 26 april, det vill säga under den period då fiskdödligheten var som högst. Kiselalger som förekommer i stora mängder kan täppa till gälarna på fiskar och därigenom orsaka kvävning.
De prover som togs av Länsstyrelsen några dagar senare visar på en dominans av cyanobakterier, även kallade blågrönalger. Vissa arter av dessa alger kan under vissa förutsättningar producera gifter, men det är oklart om så har skett i detta fall. Att dessa gifter skulle döda fisk är dock mycket ovanligt.
– De provsvar vi har fått pekar på att syrebrist till följd av algblomning efter de tidigare veckornas värmebölja kan vara anledningen till fiskdöden i Hjälmaren. Kopplingen är däremot inte lika stark som den man såg 2018 då mängder med fisk dog på grund av det varma vädret och de extensiva algblomningarna. För att utesluta andra möjliga orsaker följer vi upp med toxinanalyser samt en undersökning av tungmetaller i den döda fisken, säger Irene Karlsson Elfgren, samordnare vattenförvaltning på Länsstyrelsen i Södermanlands län.